Первоначально собор был основан как молельный дом кальвинистов. В ХVII веке, при Сапегах, храм стал костелом святого Архангела Михаила. Тогда же достроили 35-метровую башню-звонницу. В 60-х годах XIX века здание превращено в православную Спасо-Преображенскую церковь. В 1935 году храм был закрыт, иконостас разобран и сожжен. Во время войны немцы устроили здесь склад оружия. После войны постройка использовалась в качестве склада, а после в ней разместился музей ремесел и народных промыслов.
С 1990 году в храме вновь начались православные богослужения.